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Pathog Dis ; 75(6)2017 08 31.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-28859310

RESUMO

The correct identification of bacteria from the Burkholderia cepacia complex (Bcc) is crucial for epidemiological studies and treatment of cystic fibrosis infections. However, genome-based identification tools are revealing many controversial Bcc species assignments. The aim of this work is to re-examine the taxonomic position of the soil bacterium B. cepacia 89 through polyphasic and genomic approaches. recA and 16S rRNA gene sequence analysis positioned strain 89 inside the Bcc group. However, based on the divergence score of seven concatenated allele sequences, and values of average nucleotide identity, and digital DNA:DNA hybridization, our results suggest that strain 89 is different from other Bcc species formerly described. Thus, we propose to classify Burkholderia sp. 89 as the novel species Burkholderia catarinensis sp. nov. with strain 89T (=DSM 103188T = BR 10601T) as the type strain. Moreover, our results call the attention to some probable misidentifications of Bcc genomes at the National Center for Biotechnology Information database.


Assuntos
Complexo Burkholderia cepacia/genética , Burkholderia/genética , Efeito Fundador , Genoma Bacteriano , Filogenia , Microbiologia do Solo , Burkholderia/classificação , Burkholderia/isolamento & purificação , Burkholderia/metabolismo , Complexo Burkholderia cepacia/classificação , Complexo Burkholderia cepacia/isolamento & purificação , Complexo Burkholderia cepacia/metabolismo , Código de Barras de DNA Taxonômico , DNA Bacteriano/genética , DNA Bacteriano/metabolismo , Redes e Vias Metabólicas/genética , Hibridização de Ácido Nucleico , RNA Ribossômico 16S/genética , RNA Ribossômico 16S/metabolismo , Recombinases Rec A/genética , Recombinases Rec A/metabolismo , Análise de Sequência de DNA , Especificidade da Espécie , Terminologia como Assunto
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